Naruto lahir sebagai anak dari Hokage Keempat, Minato Namikaze, dan jinchūriki kedua dari Siluman Ekor Sembilan, Kushina Uzumaki. Orang tua Naruto memberikan nama Naruto dari karakter utama buku pertama Jiraiya, yang menjadi kakek Naruto
Sebelum kelahiran Naruto, orang tua dan Hokage Ketiga tahu bahwa segel yang Sembilan-ekor dalam Kushina akan berada dalam bahaya saat melahirkan. Untuk mencegah bahwa ancaman Kushina dibawa jauh di luar desa untuk melahirkan di tempat yang aman dan rahasia dengan Biwako Sarutobi dan Taji sebagai bidan, seorang ANBU
